268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1450 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  60.38 
 
 		 283 aa  330  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  62.86 
 
 		 283 aa  329  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  63.27 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  63.27 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  63.27 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  63.27 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  63.27 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  60 
 
 		 283 aa  327  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  61.63 
 
 		 283 aa  325  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  61.63 
 
 		 283 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  62.35 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  38.75 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  38.46 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  38.46 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  38.46 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  38.46 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  38.46 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  38.46 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  38.46 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  38.46 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  39.43 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  37.4 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  36.9 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  38.08 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  36.78 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  36.78 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  37.12 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  37.31 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  37.12 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  38.66 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  38.66 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  36.74 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  38.29 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  33.2 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.8 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  30.99 
 
 		 252 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 289 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  30.4 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  33.59 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  34.11 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  30.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  37.06 
 
 		 269 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  31 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  36.36 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  30.52 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  33.64 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  36.61 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  31.78 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  34.1 
 
 		 537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  33.2 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2427  formate/nitrite transporter  30.86 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000401704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2475  formate/nitrite transporter  30.86 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000187087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  29.03 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  33.62 
 
 		 483 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  33.91 
 
 		 558 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  35.59 
 
 		 483 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  31.14 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  32.08 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.09 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  32.82 
 
 		 483 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  30.86 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  28.33 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  32.1 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  33.62 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  34.65 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  34.95 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  32.86 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  28.63 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  30.65 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  32.18 
 
 		 491 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  27.84 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  33.94 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  33.94 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  31.52 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  33.75 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  33.75 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  33.75 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  32.37 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  31.47 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  32.86 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  30.55 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  26.37 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  29.96 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  31.22 
 
 		 382 aa  106  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  31.93 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  34.71 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  33.05 
 
 		 494 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  31.6 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  31.67 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0288  formate/nitrite transporter  29.8 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0295  formate/nitrite transporter  29.8 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>