218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0074 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 285 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  46.5 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  39.31 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  39.08 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  37.93 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  38.43 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  38.28 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  40.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  39.2 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  39.04 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  38.65 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  38.65 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  38.71 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  38.65 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  35.32 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  37.55 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  37.55 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  37.55 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  35.57 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  30.92 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  31.33 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  33.19 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  31.33 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  31.33 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  31.33 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  31.33 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  31.33 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  31.62 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  32.48 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  32.05 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  31.46 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  35.11 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  36.96 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  39.33 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  33.72 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  35.11 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  37.05 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  33.73 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  27.78 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  36.82 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  34.13 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  34.18 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  34.6 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  30.13 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  31.05 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  37.25 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  34.62 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  30.49 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  31.05 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  31.05 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  31.05 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  31.69 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  35.75 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  31.69 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  35.98 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  32.58 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  30.65 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  38.89 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  30.86 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  30.86 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  32.21 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  31.75 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  29.92 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  29.95 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  31.58 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.38 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  32.39 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  32.39 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  32.39 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  29.62 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  27.67 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  34.27 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  28.06 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  29.62 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  29.62 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  29.62 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  29.62 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  28.74 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  32.86 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  32.86 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  32.23 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  29.07 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  27.88 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  28.79 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  33.04 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  29.67 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  32.13 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  27.71 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  29.01 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  28.95 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  30.22 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>