215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 		 271 aa  534  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  60.7 
 
 		 289 aa  291  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  46.8 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  37.18 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  36.55 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  42.49 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  42.86 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  42.86 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  42.86 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  42.86 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  42.86 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  42.86 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  42.42 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  42.42 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  42.42 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  41.88 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  42.17 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  42.17 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  41.88 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  41.88 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  42.17 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  42.17 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  42.17 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  34.76 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  29.77 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  34.76 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  29.26 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  28.89 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  28.89 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  28.89 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  28.89 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  28.89 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  28.89 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  28.89 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  29.15 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  37.4 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  35.06 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  35.08 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  30.42 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  33.63 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  32.22 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  28.16 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  31.64 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  27.84 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  31.64 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  31.64 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  32.13 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  32.13 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  31.5 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  31.5 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  31.5 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  30.37 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  31.5 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  32.03 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  30.86 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  31.64 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  31.45 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  32.27 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  31.45 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  31.45 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  31.45 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  32.3 
 
 		 286 aa  98.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  31.05 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  30.16 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  30.16 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  30.16 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  30.16 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  30.16 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  31.45 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  31.45 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  40.48 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  31.78 
 
 		 483 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  32.77 
 
 		 483 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  30.35 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  30.43 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  30.59 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  34.73 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  33.04 
 
 		 271 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  31.42 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  31.42 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  31.42 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  30.74 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  28.96 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  31.38 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  30.43 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  29.76 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  29.96 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  28.79 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  33.2 
 
 		 269 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>