217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4597 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  86.09 
 
 		 268 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  86.09 
 
 		 268 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  86.47 
 
 		 268 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  86.09 
 
 		 268 aa  471  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  87.59 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  86.09 
 
 		 268 aa  471  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  87.97 
 
 		 268 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  86.47 
 
 		 268 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  87.97 
 
 		 268 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  85.71 
 
 		 268 aa  470  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  86.09 
 
 		 268 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  87.69 
 
 		 269 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  85.71 
 
 		 268 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  87.69 
 
 		 269 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  85.71 
 
 		 269 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  85.34 
 
 		 289 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  85.34 
 
 		 269 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  89.02 
 
 		 269 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  43.03 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  44.76 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  37.74 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  39.62 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  39.25 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  40 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  39.23 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  37.16 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  38.24 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  38.24 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  38.24 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  38.24 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  38.24 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  38.13 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  37.31 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  38.22 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  31.98 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  39.91 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  37.66 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  41.63 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  30.82 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  35.36 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  35.6 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  34.94 
 
 		 292 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  32.94 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  31.28 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  37.33 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  34.69 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  32.16 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  35.78 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  32.92 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.79 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  32.2 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  30.67 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  33.19 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  30.11 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  31.92 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  29.74 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  34.55 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  32.95 
 
 		 318 aa  99  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  32.31 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  31.54 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  36.02 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  29.89 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  29.89 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  29.89 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  29.89 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  35.24 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  29.89 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  30.11 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  29.89 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  29 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  31.37 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  31.85 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  34.26 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  32.5 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  31.82 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.25 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 425 aa  92.8  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  30.34 
 
 		 537 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  28.96 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  31.4 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  31.4 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  31.4 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  32.19 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  34.65 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  33.62 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  33.62 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  32.05 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  33.62 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  33.62 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  31.4 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  31.87 
 
 		 483 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  31.4 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  30.19 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  29.66 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  30.62 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  32.17 
 
 		 483 aa  85.5  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  29.88 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  33.17 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>