221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1640 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  87.15 
 
 
286 aa  482  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  38.38 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  37.5 
 
 
301 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  34.8 
 
 
296 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  33.21 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  36.55 
 
 
293 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  32.48 
 
 
285 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  33.82 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  31.72 
 
 
280 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  32.48 
 
 
286 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  32.23 
 
 
278 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  34.9 
 
 
558 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  31.77 
 
 
303 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  33.21 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  30.96 
 
 
275 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  38.06 
 
 
483 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  36.43 
 
 
483 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  35.66 
 
 
483 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  31.87 
 
 
285 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  31.87 
 
 
285 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  31.87 
 
 
285 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  34.38 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  33.21 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  34.28 
 
 
301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  31.39 
 
 
271 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  32.36 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  31.14 
 
 
270 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.97 
 
 
301 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  33.11 
 
 
286 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  32.98 
 
 
316 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  31.73 
 
 
285 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  31.38 
 
 
286 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  35.16 
 
 
425 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  30.55 
 
 
286 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  32.81 
 
 
271 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  31.53 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.09 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  29 
 
 
318 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  32.41 
 
 
271 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  32.41 
 
 
271 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  32.41 
 
 
271 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  32.41 
 
 
271 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  32.63 
 
 
323 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  29.23 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  32.93 
 
 
537 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  33.76 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  30.32 
 
 
273 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  30.32 
 
 
273 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  35.13 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  30.32 
 
 
273 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  30.32 
 
 
273 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  32.41 
 
 
491 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  32.77 
 
 
330 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  32.77 
 
 
330 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  32.77 
 
 
330 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  32.73 
 
 
287 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  32.77 
 
 
330 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  32.05 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  32.05 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  27.27 
 
 
284 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  29.67 
 
 
259 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  31.62 
 
 
324 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29.67 
 
 
259 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29.67 
 
 
259 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29.67 
 
 
259 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  33.82 
 
 
265 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  29.63 
 
 
282 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.67 
 
 
259 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  28.52 
 
 
282 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  29.57 
 
 
508 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  28.52 
 
 
282 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  28.52 
 
 
282 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  28.52 
 
 
282 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  28.52 
 
 
282 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  28.52 
 
 
282 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  28.52 
 
 
282 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 
290 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  28.09 
 
 
271 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.96 
 
 
289 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  30.26 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  27.68 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  27.68 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  27.68 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  27.68 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  28.42 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  27.68 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  30.14 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  27.09 
 
 
271 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  29.07 
 
 
493 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  27.09 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>