228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1038 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  99.63 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  99.63 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  99.63 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  99.63 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  95.94 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  93.73 
 
 		 285 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  84.07 
 
 		 286 aa  474  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  80.81 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  80.81 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  80.81 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  79.7 
 
 		 286 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  78.97 
 
 		 285 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  78.23 
 
 		 285 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  81.18 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  64.58 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  56.7 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  56.67 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  57.04 
 
 		 286 aa  322  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  55.26 
 
 		 303 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  60.53 
 
 		 289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  52.63 
 
 		 483 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  51.13 
 
 		 483 aa  279  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  52.85 
 
 		 558 aa  278  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  51.13 
 
 		 483 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  53.26 
 
 		 491 aa  271  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  50.37 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  50.37 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  50.37 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  50.94 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  50.37 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  54.44 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  54.05 
 
 		 330 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  54.05 
 
 		 330 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  54.05 
 
 		 330 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  54.05 
 
 		 330 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  55.21 
 
 		 324 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  50 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  50.75 
 
 		 537 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  50.57 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  54.05 
 
 		 324 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  54.05 
 
 		 324 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  50.57 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  53.64 
 
 		 494 aa  257  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  52.9 
 
 		 493 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  50.2 
 
 		 508 aa  241  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  47.15 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2864  formate/nitrite transporter  50.47 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.666076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  40.15 
 
 		 316 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  38.93 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1500  formate transporter  44.22 
 
 		 547 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  38.35 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  40.39 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  38.29 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  40.68 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  37.83 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  39.11 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  37.31 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  39.46 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  37.37 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  36.68 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  36.23 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  37.45 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  37.93 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  35.86 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  39.41 
 
 		 425 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  37.79 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  33.68 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  35.46 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  35.11 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  31.5 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  32.27 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  31.1 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  34.25 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  31.45 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  31.76 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  29.63 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  30.85 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  29.82 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  31.75 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  31.06 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  28.52 
 
 		 382 aa  105  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  28.46 
 
 		 323 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  32.62 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  31.85 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  30.14 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  28.78 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  28.78 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  28.78 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  28.78 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>