156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1084 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  31.76 
 
 
273 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2427  formate/nitrite transporter  28.29 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000401704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2475  formate/nitrite transporter  28.29 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000187087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 
276 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0288  formate/nitrite transporter  31.64 
 
 
281 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0295  formate/nitrite transporter  31.64 
 
 
281 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  30.83 
 
 
268 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  30.24 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  26.28 
 
 
289 aa  89.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  30.24 
 
 
283 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  29.84 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  29.84 
 
 
283 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  29.84 
 
 
283 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  29.84 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  29.84 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  30.24 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  30.24 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1449  formate/nitrite transporter  27.91 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.748577  normal  0.576318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  27.83 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  30.18 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  29.44 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  30.89 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  30.99 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  29.34 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  30 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  30.24 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  29.57 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  29.57 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  29.57 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  29.57 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  29.57 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  29 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  27.8 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  29.96 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  29.96 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  29.26 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  29.96 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  28.88 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  30.36 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  29.96 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  29.52 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  29.96 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  30.36 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  29.1 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  30.36 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  28.62 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  28.62 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  28.62 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  28.62 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  29.18 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  31.78 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  28.63 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  27.35 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  27.98 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  27.71 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  28.04 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  27.14 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  29.1 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  29.1 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  26.92 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  26.92 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  26.92 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  26.92 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  32.04 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  27.48 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  26.92 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  26.92 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  26.92 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  28.86 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  27.17 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  31.49 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  27.64 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  25.64 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  25.64 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.47 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  28.17 
 
 
537 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  26.18 
 
 
271 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
286 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  25.57 
 
 
263 aa  58.9  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  25.82 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  25.82 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  25.82 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  27.17 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  25.88 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  25.82 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>