208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2475 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2427  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000401704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2475  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000187087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  77.66 
 
 		 273 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0288  formate/nitrite transporter  43.65 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0295  formate/nitrite transporter  43.65 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  30.86 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1449  formate/nitrite transporter  24.91 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.748577  normal  0.576318 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  28.29 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  32.64 
 
 		 537 aa  105  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  28.46 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  26.64 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  26.44 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  26.44 
 
 		 283 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  26.15 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  26.15 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  26.15 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  26.15 
 
 		 283 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  26.15 
 
 		 283 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  26.15 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  26.05 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  26.29 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  31.1 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  35.33 
 
 		 494 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  33.02 
 
 		 558 aa  89  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  27.78 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  33.64 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  26.82 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  32.8 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 491 aa  85.5  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  29.96 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  32.28 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  29.32 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  32.28 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  30.54 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  31.84 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  29.32 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  29.11 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  31.33 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  27.31 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  27.18 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  30.39 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  26.02 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  31.75 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  25.4 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  25.2 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  31.75 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  26.92 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  29.9 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  29.9 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  29.9 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  29.9 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  31.22 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  31.22 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  31.22 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  31.22 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  31.22 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34810  formate/nitrite transporter family protein  28.84 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  25.33 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  31.22 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  25.56 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  28.69 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  31.09 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  31.22 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  28.14 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  27.76 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  27.76 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  26.69 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  26.69 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  27.76 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  27.76 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  27.76 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  27.76 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  27.76 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  27.76 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  26.69 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  27.78 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  28.57 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  27.88 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  26.88 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  27.86 
 
 		 301 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  26.89 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  26.89 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  27.15 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  25.82 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  25.66 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  25.84 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  26.67 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  26.75 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  26.44 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  28.33 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  27.93 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  27.98 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  27.98 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  25.58 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  28.75 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  27.75 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  25 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>