193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1449 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1449  formate/nitrite transporter  100 
 
 
298 aa  591  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.748577  normal  0.576318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34810  formate/nitrite transporter family protein  65.73 
 
 
283 aa  317  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0288  formate/nitrite transporter  35.13 
 
 
281 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0295  formate/nitrite transporter  35.13 
 
 
281 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  26.67 
 
 
273 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2427  formate/nitrite transporter  24.91 
 
 
274 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000401704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2475  formate/nitrite transporter  24.91 
 
 
274 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000187087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  30.58 
 
 
283 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  29.86 
 
 
283 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  29.86 
 
 
283 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  29.64 
 
 
283 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  31.14 
 
 
276 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  29.82 
 
 
283 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  29.82 
 
 
283 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  29.82 
 
 
283 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  29.2 
 
 
283 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  29.2 
 
 
283 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  31.3 
 
 
283 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  29.26 
 
 
277 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  30.13 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  27.91 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  26.77 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  29.48 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  27.65 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  29.61 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  31.72 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  27.78 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  29.35 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  29.07 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  29.12 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  31.67 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  29.59 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  30.34 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  32.88 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  27.83 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  28.77 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  28.18 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  28.18 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  29.48 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  29.6 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  26.89 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  29.3 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  25.78 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  29.2 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  31.86 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  26.42 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  32.46 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  26.89 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  28.43 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  28.43 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  31.79 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  25.29 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  29.28 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  30.59 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  28.1 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  29.21 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  28.82 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  25.4 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  29.27 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  26.61 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  29.11 
 
 
269 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  24.62 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  29.06 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  28.11 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  24.03 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  28.11 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  29.19 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  28.99 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  28.26 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  26.87 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  28.11 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  26.34 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  28.05 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  31.44 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  26.61 
 
 
483 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  28.98 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  25.75 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  27.04 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  28.47 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  28.31 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  29.29 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  28.25 
 
 
272 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  27.54 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  26.75 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  26.75 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  26.75 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  26.44 
 
 
271 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  28.11 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  26.39 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  27.54 
 
 
269 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  29.47 
 
 
318 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.516822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>