More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4953 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  280  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 202 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.62 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  32.12 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  29.5 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  30 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  30.53 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 531 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  28.89 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  31.43 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 944 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  32.03 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  29.23 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  29.93 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 935 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  30.08 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  34.75 
 
 		 531 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  33.08 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  29.01 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  31.75 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1322 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>