More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4440 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  290  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  43.26 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  42.14 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  39.29 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  37.24 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  35.77 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  34.72 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.55 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  36.81 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.57 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  38.03 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  35.86 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  35.86 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  35.86 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  37.96 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.13 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 153 aa  94.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 155 aa  93.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  38.41 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  36.11 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  37.68 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  39.72 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  34.72 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 152 aa  90.1  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  34.53 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  32.85 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  40.58 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  35.34 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.62 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  38.62 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 144 aa  85.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  36.15 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  33.08 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>