More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1796 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1796  histidine kinase  100 
 
 		 577 aa  1190    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4099  histidine kinase  29.76 
 
 		 600 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  decreased coverage  0.000691518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3950  histidine kinase  28.18 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.365281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3173  histidine kinase  25.35 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286696  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  29.82 
 
 		 539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 870 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 970 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 898 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 810 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  31.07 
 
 		 1137 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  30.5 
 
 		 1077 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 695 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 977 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 667 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 1137 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 858 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1143 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  31.54 
 
 		 998 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1917 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 827 aa  151  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1163 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1037 aa  150  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 859 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  29.42 
 
 		 781 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 939 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 982 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 944 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 1145 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1195 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  27.55 
 
 		 859 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  30 
 
 		 948 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1158 aa  148  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 1131 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1002 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 737 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1044 aa  146  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  30.26 
 
 		 746 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27.86 
 
 		 1871 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 657 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 823 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  28.18 
 
 		 1257 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1155 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 		 947 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1064 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 1122 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1287 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 935 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  30.41 
 
 		 882 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 913 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  29.45 
 
 		 1170 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  30.52 
 
 		 1172 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.76 
 
 		 667 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 1361 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 995 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 		 1058 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 633 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  28.54 
 
 		 1060 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 750 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1128 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 772 aa  144  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 813 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 1127 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 1068 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 1127 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  27.35 
 
 		 835 aa  143  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1155 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  28.39 
 
 		 794 aa  143  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1149 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  28.26 
 
 		 1213 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1352 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  29.18 
 
 		 1122 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  27.81 
 
 		 858 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 902 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 822 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 1122 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  30.05 
 
 		 1361 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 835 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  27.11 
 
 		 938 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 944 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  28.04 
 
 		 1121 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 645 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 1158 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1141 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 647 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 1070 aa  141  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1070  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 575 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677044  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 922 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2407  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 1055 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 920 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 734 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 912 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 774 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 1101 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 		 951 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  27.86 
 
 		 779 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  28.99 
 
 		 1028 aa  140  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 1154 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 796 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>