More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3405 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  520  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  32.4 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  31.33 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  28.23 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  28.23 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1946  DNA-binding response regulator  25 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 513 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  30.09 
 
 		 1296 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  28.22 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  28.22 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  28.22 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  28.22 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 1201 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  31.2 
 
 		 1400 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  39.67 
 
 		 515 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  27.2 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 365 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  36.57 
 
 		 509 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 538 aa  95.5  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 503 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  36.92 
 
 		 509 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 507 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 507 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 526 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  27.2 
 
 		 289 aa  92  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 543 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 508 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 532 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 544 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  27.42 
 
 		 1370 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  26.83 
 
 		 1344 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 548 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  27.73 
 
 		 1355 aa  88.6  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 386 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 525 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 535 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 546 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 219 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 216 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 532 aa  85.9  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  42 
 
 		 530 aa  85.5  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 531 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  26.95 
 
 		 1378 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 548 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 502 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.9 
 
 		 1363 aa  82  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  28.29 
 
 		 1306 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  26.45 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  36.52 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 1341 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.71 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.88 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 494 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 542 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  36.84 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.84 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.52 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>