More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1946 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1946  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 257 aa  530  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  31.35 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  31.33 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  30.92 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  29.53 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  28.63 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  38.76 
 
 		 509 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 502 aa  95.5  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 1201 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 538 aa  92  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 509 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  37.69 
 
 		 507 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 546 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 548 aa  89  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 507 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 365 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 414 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  26.88 
 
 		 1355 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  27.78 
 
 		 1324 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 526 aa  82  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 529 aa  82  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  27.52 
 
 		 1296 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  25.6 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  25.6 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  25.6 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  25.69 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  25.6 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 532 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 519 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  24.8 
 
 		 1388 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  23.9 
 
 		 1374 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 534 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.39 
 
 		 1414 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 934 aa  73.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  24.42 
 
 		 1376 aa  73.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  26.14 
 
 		 1313 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 519 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0470  sigma-54 dependent response regulator  31.47 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.06 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  23.37 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  25.69 
 
 		 1311 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  25 
 
 		 663 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  25 
 
 		 1347 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1965  response regulatory protein, sigma 54 related  34.43 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0275961  normal  0.129103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  25 
 
 		 1404 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.19 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.22 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  25.93 
 
 		 1278 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  24.11 
 
 		 1397 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.21 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 1341 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3615  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.06 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 531 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  30.91 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  35 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.63 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  23.44 
 
 		 1370 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  34.43 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.72 
 
 		 1396 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.25 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  34.13 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  23.29 
 
 		 1344 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  25.62 
 
 		 1374 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>