More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2709 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  43.22 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  41.32 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 204 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  44.07 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  40.68 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  43.22 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  40.68 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  39.5 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.46 
 
 		 348 aa  93.6  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 553 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  42.28 
 
 		 248 aa  90.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 1271 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.3 
 
 		 313 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 376 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 312 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  43.08 
 
 		 204 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.84 
 
 		 349 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4015  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.61 
 
 		 315 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 217 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  38.71 
 
 		 384 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 376 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 383 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 383 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  40.16 
 
 		 365 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2864  two-component response regulator  36.43 
 
 		 383 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384945  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  42.62 
 
 		 240 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 369 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 846 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3669  diguanylate cyclase  36.89 
 
 		 300 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29300  Response regulator  43.09 
 
 		 310 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.95 
 
 		 308 aa  87.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 331 aa  87  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  41.67 
 
 		 457 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0836  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 395 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.8 
 
 		 434 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.84 
 
 		 443 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  42.5 
 
 		 455 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 356 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  44.63 
 
 		 461 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 		 363 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 948 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.84 
 
 		 443 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.8 
 
 		 434 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1016 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 304 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 349 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  44.86 
 
 		 204 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.66 
 
 		 233 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2304  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0766818  normal  0.411617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.68 
 
 		 328 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  41.8 
 
 		 240 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.4 
 
 		 310 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  41.18 
 
 		 237 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 383 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.2 
 
 		 412 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.2 
 
 		 354 aa  84.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 395 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 247 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  36.59 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  40.83 
 
 		 457 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 200 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  41.18 
 
 		 237 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 367 aa  84  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.83 
 
 		 319 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  41.67 
 
 		 457 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1361 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  39.53 
 
 		 361 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>