More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7058 on replicon NC_013737
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  100 
 
 		 166 aa  348  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  53.9 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  40.49 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1129  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  41.61 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5165  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 136 aa  94.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 138 aa  94  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 137 aa  87.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  33.83 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  33.6 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  28.06 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  28.99 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  28.36 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  29.69 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  30.6 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  23.91 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  26.62 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  29.32 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  24.26 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  23.31 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  24.49 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1567  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  25.37 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  25.38 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  24.06 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  25.56 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  27.61 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  26.81 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  25 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  23.74 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 713 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>