More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5155 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5165  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1129  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  30 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.89 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  25.58 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  30.53 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  25.71 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  29.41 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  28.26 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 229 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  29.41 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  33.6 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.6 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 229 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  26.67 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  26.36 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  27.27 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 241 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  28.69 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  26.76 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  26.28 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 165 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  32.8 
 
 		 229 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  24.43 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  24.44 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  28.8 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.16 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  25.93 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  33.09 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  33.61 
 
 		 1373 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  30.16 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  27.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.5 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  25.95 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  25 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  27.4 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  25 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.58 
 
 		 464 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  25.42 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 145 aa  48.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  25.93 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2050  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 511 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.155124  hitchhiker  0.000156568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  34.43 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.13 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0905  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 394 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>