More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0355 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  100 
 
 		 464 aa  959    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.54 
 
 		 454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 414 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.27 
 
 		 715 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.923401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1350  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.27 
 
 		 715 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  28.42 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  29.37 
 
 		 456 aa  142  9e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  26.87 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  26.36 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  29.43 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 440 aa  140  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  31.41 
 
 		 466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.36 
 
 		 708 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.29 
 
 		 715 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.15 
 
 		 708 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.73 
 
 		 707 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.864356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  24.84 
 
 		 460 aa  133  7.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.17 
 
 		 980 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  28.57 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 436 aa  133  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 		 1049 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  28.85 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5008  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.04 
 
 		 708 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0507  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.33 
 
 		 706 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3081  sensory box protein/response regulator  28.73 
 
 		 710 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.789878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  25.48 
 
 		 719 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  26.75 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  26.74 
 
 		 719 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.79 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  27.18 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.61 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 418 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 		 306 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.02 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.05 
 
 		 706 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780244 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  26.49 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 452 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.2 
 
 		 711 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7031  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.49 
 
 		 1327 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24 
 
 		 860 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  33.17 
 
 		 321 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  37.42 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 576 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3131  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 328 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1618  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.69 
 
 		 315 aa  103  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.465864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  35.03 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.52 
 
 		 869 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  25.52 
 
 		 705 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.16 
 
 		 869 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0987  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1202  GGDEF domain-containing protein  30.09 
 
 		 324 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  35.54 
 
 		 357 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 202 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1520  GGDEF domain-containing protein  35.37 
 
 		 323 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  33.97 
 
 		 314 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2682  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  26.24 
 
 		 596 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 200 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.28 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2357  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0588  hypothetical protein  27 
 
 		 903 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  25.77 
 
 		 705 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0171  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.37 
 
 		 808 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000289521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  26.28 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2451  putative diguanylate cyclase  30.07 
 
 		 651 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.31 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4307  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.67 
 
 		 708 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245048  normal  0.0798721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0356  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.41 
 
 		 667 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.589026  normal  0.448313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2626  diguanylate cyclase  33.73 
 
 		 591 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0100044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 397 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  43.9 
 
 		 1366 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1675  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.12 
 
 		 528 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  32.12 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  32.12 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  32.12 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  25.99 
 
 		 852 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1829  GGDEF domain-containing protein  27.69 
 
 		 344 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  32.95 
 
 		 908 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  30.25 
 
 		 696 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  32.6 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  24.07 
 
 		 429 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  41.46 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4515  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 363 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3603  GGDEF domain-containing protein  30.63 
 
 		 641 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.74 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0346  diguanylate cyclase  44.21 
 
 		 570 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.27 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.75 
 
 		 675 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  32.91 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  26.52 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>