More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4888 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 141 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  41.4 
 
 		 166 aa  131  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 140 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1129  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5165  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 144 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  34.59 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  36.09 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  32.33 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  26.87 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  40 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  26.47 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  26.12 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  32.84 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 146 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 167 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  26.52 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  30.14 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  29.63 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 160 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  28.31 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  28.36 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  30.37 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  35.43 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  28.15 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  27.4 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  27.54 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  34.51 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  28.37 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  25.9 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  26.72 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  28.15 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  30 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  24.48 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  29.01 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>