More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3788 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  100 
 
 		 152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  43.57 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  33.1 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  37.14 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 202 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  34.35 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  35.2 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 289 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  39.74 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  32.26 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38278  predicted protein  30.77 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 292 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  33.6 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  37.63 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  42.47 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.14 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 		 531 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  43.04 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 935 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  40.51 
 
 		 531 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3630  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 		 411 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  29.85 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 406 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 492 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 1356 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  35 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 311 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  47.62 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  42.65 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  37.08 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  34.38 
 
 		 568 aa  62.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.03 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  33.11 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1530  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  0.960974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4510  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.078722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1372  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 434 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  44.62 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>