More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1464 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.64 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  36.59 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 935 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 945 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 202 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  34.78 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.23 
 
 		 655 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 989 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 989 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  34.65 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  35.85 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 759 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 406 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  33.02 
 
 		 351 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  32.74 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 767 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  35.2 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  31.97 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  31.78 
 
 		 368 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3950  response regulator/GGDEF domain-containing protein  32.8 
 
 		 566 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1828  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000105938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.04 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 1127 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 719 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.69 
 
 		 1331 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  31.01 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  33.96 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  30.95 
 
 		 2301 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  31.71 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.4 
 
 		 919 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 214 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0183  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.71 
 
 		 387 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  31.43 
 
 		 411 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1168 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  28.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  30.48 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.09 
 
 		 1197 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  30.89 
 
 		 1376 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>