More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4655 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 196 aa  136  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  41.61 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5165  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1129  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  28.89 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  28.89 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  31.88 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  28.89 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  27.82 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  27.7 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  30.6 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0326  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  27.34 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  24.83 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  25.87 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  28.36 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  25.18 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  33.94 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  30 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  28.46 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 148 aa  57  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  27.21 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  24.65 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  30.66 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  26.32 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  27.69 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  26.52 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  30 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2881  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000073998  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>