More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06169 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  100 
 
 		 1225 aa  2545    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1259  sensory box sensor histidine kinase/response regulator VieS  38.55 
 
 		 1146 aa  806    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1177  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 746 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  25.15 
 
 		 1286 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  30.51 
 
 		 1122 aa  232  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.16 
 
 		 1196 aa  226  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1436 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1436 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 1002 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  23.66 
 
 		 1213 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  25.99 
 
 		 1040 aa  209  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 782 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 859 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 		 1029 aa  205  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  23.67 
 
 		 1206 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 		 1001 aa  204  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 		 1214 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.18 
 
 		 772 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 736 aa  201  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  28.41 
 
 		 952 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  26.66 
 
 		 934 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 1049 aa  199  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  27.22 
 
 		 497 aa  199  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  28.83 
 
 		 785 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 863 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  29 
 
 		 891 aa  197  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 1199 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 787 aa  196  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 1014 aa  195  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  29.06 
 
 		 988 aa  195  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 1363 aa  195  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 1032 aa  195  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1033 aa  195  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  28.25 
 
 		 968 aa  195  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 970 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  28.52 
 
 		 882 aa  194  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 1032 aa  194  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.08 
 
 		 951 aa  194  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 1068 aa  194  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  28.09 
 
 		 785 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 816 aa  194  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  28.09 
 
 		 785 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 959 aa  193  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  29.57 
 
 		 583 aa  193  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 932 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 924 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1011 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1002 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  28.73 
 
 		 785 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 781 aa  192  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 939 aa  192  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 948 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  29.22 
 
 		 578 aa  191  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 1101 aa  191  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 925 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  30.68 
 
 		 943 aa  190  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 573 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 1287 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1433 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  25.93 
 
 		 951 aa  189  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  29.16 
 
 		 641 aa  188  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1195 aa  188  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 731 aa  188  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  25.39 
 
 		 827 aa  188  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 572 aa  187  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 1120 aa  187  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 921 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 744 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 631 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 801 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1075 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 		 1141 aa  186  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 641 aa  186  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  29.84 
 
 		 645 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 930 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 627 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  28.66 
 
 		 651 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 947 aa  185  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 822 aa  184  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 785 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 944 aa  185  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 685 aa  184  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1070 aa  184  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  29.05 
 
 		 589 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  28.63 
 
 		 778 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1452 aa  184  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  27.91 
 
 		 786 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2327  ATP-binding region ATPase domain protein  29.74 
 
 		 758 aa  184  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.68 
 
 		 796 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  28.37 
 
 		 797 aa  184  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  28.63 
 
 		 830 aa  184  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 662 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 643 aa  184  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 507 aa  184  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 		 1302 aa  183  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1015 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23.6 
 
 		 1197 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 803 aa  182  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 1201 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 815 aa  181  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>