More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1259 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1259  sensory box sensor histidine kinase/response regulator VieS  100 
 
 
1146 aa  2373    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  38.55 
 
 
1225 aa  806    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1177  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
746 aa  483  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
1196 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  25.98 
 
 
1209 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  25.65 
 
 
1213 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.8 
 
 
1214 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 
1201 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  24.7 
 
 
1286 aa  228  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  25.94 
 
 
1212 aa  228  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1029 aa  228  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1418 aa  227  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  24.7 
 
 
1040 aa  221  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1436 aa  220  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
782 aa  220  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 
1199 aa  218  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  24.73 
 
 
1206 aa  217  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1436 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.75 
 
 
955 aa  213  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  28.81 
 
 
606 aa  212  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1162 aa  211  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.97 
 
 
1210 aa  211  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  22.7 
 
 
1211 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.08 
 
 
934 aa  210  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
877 aa  207  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1011 aa  207  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
939 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
662 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
1075 aa  206  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
631 aa  205  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
948 aa  205  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.15 
 
 
951 aa  204  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
1191 aa  204  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  28.03 
 
 
943 aa  204  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
1199 aa  204  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  26.97 
 
 
949 aa  203  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1002 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  26.97 
 
 
949 aa  203  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  26.97 
 
 
957 aa  203  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
884 aa  202  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 
1788 aa  202  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.8 
 
 
949 aa  202  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.8 
 
 
933 aa  201  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  28.8 
 
 
933 aa  201  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  29 
 
 
949 aa  201  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.8 
 
 
949 aa  201  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.8 
 
 
949 aa  201  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.8 
 
 
949 aa  201  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.8 
 
 
949 aa  201  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.8 
 
 
949 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  30.93 
 
 
666 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
643 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
643 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
1015 aa  199  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
995 aa  199  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  33.19 
 
 
691 aa  199  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1433 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
859 aa  199  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.88 
 
 
1135 aa  196  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
1002 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
606 aa  195  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
731 aa  195  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  28.89 
 
 
1199 aa  195  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
817 aa  195  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
1131 aa  194  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  30.28 
 
 
968 aa  194  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
1023 aa  194  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23.05 
 
 
1127 aa  194  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
944 aa  194  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23.13 
 
 
1197 aa  193  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23.29 
 
 
1127 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23 
 
 
1197 aa  193  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
896 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 
1452 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
789 aa  192  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  29.24 
 
 
827 aa  192  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  30.61 
 
 
741 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
803 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  30.47 
 
 
782 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.68 
 
 
957 aa  192  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
1267 aa  192  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
791 aa  192  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23.29 
 
 
1197 aa  192  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23.29 
 
 
1197 aa  192  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  23.29 
 
 
1197 aa  192  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  23.29 
 
 
1197 aa  192  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  30.16 
 
 
785 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  30.41 
 
 
857 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  29.19 
 
 
1084 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1126 aa  191  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
801 aa  191  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.21 
 
 
1197 aa  191  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  32.67 
 
 
952 aa  190  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  29.3 
 
 
755 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
781 aa  190  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
633 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  30.34 
 
 
882 aa  190  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.47 
 
 
582 aa  189  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
902 aa  189  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.61 
 
 
1535 aa  188  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>