More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0738 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
925 aa  1835    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
936 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  41.67 
 
 
931 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  40.76 
 
 
935 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  46.57 
 
 
936 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  48.59 
 
 
1074 aa  505  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  47.59 
 
 
1083 aa  482  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  48.15 
 
 
1084 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  48.05 
 
 
1053 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.32 
 
 
1070 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  43.09 
 
 
1088 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.74 
 
 
933 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.7 
 
 
949 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.7 
 
 
949 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  31.74 
 
 
933 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.48 
 
 
949 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  31.51 
 
 
949 aa  393  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.37 
 
 
949 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.37 
 
 
949 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.37 
 
 
949 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.45 
 
 
955 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  37.68 
 
 
774 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.72 
 
 
948 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.34 
 
 
915 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.72 
 
 
948 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.93 
 
 
949 aa  379  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.72 
 
 
948 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.72 
 
 
948 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.38 
 
 
934 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.02 
 
 
957 aa  357  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.54 
 
 
951 aa  356  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.42 
 
 
949 aa  356  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.42 
 
 
957 aa  356  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.42 
 
 
949 aa  355  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  35.75 
 
 
1122 aa  333  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  43.27 
 
 
951 aa  322  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1022 aa  295  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1029 aa  294  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1034 aa  293  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.61 
 
 
1129 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  32.38 
 
 
1175 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
1266 aa  280  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  30.42 
 
 
1156 aa  279  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
1363 aa  277  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1436 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  39.96 
 
 
779 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  39.88 
 
 
786 aa  273  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1082 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  32.41 
 
 
1082 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 
1082 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
1064 aa  270  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  32.99 
 
 
1098 aa  269  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  38.24 
 
 
778 aa  269  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  39.42 
 
 
994 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  39.12 
 
 
1001 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
909 aa  268  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
1032 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
1326 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
787 aa  266  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  37.27 
 
 
785 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  37.13 
 
 
847 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.92 
 
 
951 aa  265  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
1202 aa  264  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1255 aa  264  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  36.19 
 
 
1309 aa  264  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1305 aa  264  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1303 aa  264  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
833 aa  263  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
738 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  37.11 
 
 
785 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1316 aa  263  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  37.33 
 
 
785 aa  263  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  37.1 
 
 
785 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  37.98 
 
 
918 aa  262  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  32.97 
 
 
1626 aa  262  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
745 aa  261  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  33.02 
 
 
765 aa  261  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.84 
 
 
1407 aa  260  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  35.45 
 
 
932 aa  260  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.43 
 
 
796 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.21 
 
 
1014 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
752 aa  258  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1131 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
899 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  35.26 
 
 
1200 aa  258  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 
1177 aa  257  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1267 aa  257  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
1397 aa  257  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6941  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1169 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0447401  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1037  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
793 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2983  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
1167 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
964 aa  256  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  35.7 
 
 
727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.91 
 
 
933 aa  255  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.2 
 
 
1331 aa  255  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.4 
 
 
1499 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.84 
 
 
932 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  37.48 
 
 
772 aa  254  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1166 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>