More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1177 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1177  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 746 aa  1537    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  39.77 
 
 		 1225 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1259  sensory box sensor histidine kinase/response regulator VieS  41.07 
 
 		 1146 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 1237 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 1436 aa  221  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 1194 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 1029 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1201 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1436 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 1196 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  34.22 
 
 		 1040 aa  213  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  28.03 
 
 		 1209 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  29.14 
 
 		 1211 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 1210 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  28.09 
 
 		 1213 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1011 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 572 aa  207  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.86 
 
 		 934 aa  205  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1287 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  30.83 
 
 		 778 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  30.69 
 
 		 882 aa  203  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1199 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 		 1191 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1199 aa  201  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 1049 aa  200  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 910 aa  200  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  32.26 
 
 		 1286 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 791 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.24 
 
 		 955 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 		 1002 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  30.94 
 
 		 741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.69 
 
 		 772 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.42 
 
 		 957 aa  198  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 1410 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 925 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.98 
 
 		 796 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  27.39 
 
 		 827 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 643 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 764 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 1011 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1001 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  30.21 
 
 		 691 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  28.7 
 
 		 977 aa  193  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 863 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 1195 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  30.04 
 
 		 1084 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  30.7 
 
 		 782 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  29.9 
 
 		 968 aa  192  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 1452 aa  192  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 627 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  29.25 
 
 		 589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 643 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 1169 aa  191  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  30.39 
 
 		 1083 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1223 aa  190  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.81 
 
 		 582 aa  190  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 874 aa  190  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 1033 aa  190  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  28.97 
 
 		 951 aa  190  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 868 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 1271 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 643 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 690 aa  189  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.69 
 
 		 738 aa  188  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  29.77 
 
 		 935 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 		 1093 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1075 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1093 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1079 aa  187  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1127 aa  187  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 678 aa  187  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 865 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 		 948 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  28.38 
 
 		 943 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 		 949 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1101 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 		 1003 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 		 949 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 1124 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 918 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 		 957 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  28.85 
 
 		 988 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 731 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  29.84 
 
 		 615 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 1032 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 939 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 939 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 1014 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1302 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1788 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  30.14 
 
 		 785 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1267 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  30.15 
 
 		 853 aa  183  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 822 aa  183  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 973 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 862 aa  183  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  27.19 
 
 		 651 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  30.13 
 
 		 641 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  29.76 
 
 		 785 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.43 
 
 		 951 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>