More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4640 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1194 aa  2432    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
1490 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  75.06 
 
 
1237 aa  1744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
1480 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
1485 aa  635  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
1436 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1436 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  36.65 
 
 
1309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
1418 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  39.35 
 
 
994 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.82 
 
 
784 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
948 aa  350  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  27.73 
 
 
1686 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1141 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  34.32 
 
 
1141 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.45 
 
 
1499 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.58 
 
 
1199 aa  305  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
940 aa  299  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.6 
 
 
1135 aa  298  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
1064 aa  290  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  26.32 
 
 
1689 aa  288  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.75 
 
 
923 aa  288  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 
807 aa  284  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1768 aa  282  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  30 
 
 
1233 aa  281  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  37.06 
 
 
977 aa  281  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
816 aa  281  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
1692 aa  281  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1260 aa  280  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.71 
 
 
1014 aa  280  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.69 
 
 
934 aa  279  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
916 aa  278  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2675  sensor histidine kinase/response regulator  39.5 
 
 
651 aa  278  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.38 
 
 
796 aa  277  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.9 
 
 
1653 aa  277  9e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
1236 aa  277  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
1193 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1255 aa  276  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
1234 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
678 aa  275  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 
1626 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1234 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.4 
 
 
951 aa  274  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1238 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
1054 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.14 
 
 
951 aa  273  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  37.48 
 
 
847 aa  272  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  34.97 
 
 
1322 aa  271  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.33 
 
 
1177 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  32.86 
 
 
1064 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
721 aa  271  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  35.81 
 
 
783 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
1238 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
1238 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
1238 aa  270  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
1245 aa  269  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  28.79 
 
 
1236 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1310 aa  269  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
964 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
1426 aa  268  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1340 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1202 aa  267  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  32.63 
 
 
1255 aa  266  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1118 aa  266  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  34.95 
 
 
951 aa  265  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.17 
 
 
1763 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1767 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
929 aa  263  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1316 aa  263  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 
1767 aa  263  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.62 
 
 
1331 aa  262  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
812 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
1767 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.92 
 
 
949 aa  260  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
909 aa  260  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.73 
 
 
948 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.91 
 
 
949 aa  259  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  32.65 
 
 
1122 aa  259  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.91 
 
 
949 aa  259  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.73 
 
 
948 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  38.02 
 
 
901 aa  259  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.73 
 
 
948 aa  259  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  33.91 
 
 
949 aa  258  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.73 
 
 
948 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  33.67 
 
 
1021 aa  258  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.22 
 
 
1179 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.73 
 
 
915 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.91 
 
 
949 aa  258  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
818 aa  258  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.72 
 
 
949 aa  258  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0474  sensor histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 
639 aa  258  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.72 
 
 
949 aa  258  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0878  sensor histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 
654 aa  258  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1402  sensor histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 
654 aa  258  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0684  sensor histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 
654 aa  258  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.99 
 
 
957 aa  257  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.91 
 
 
949 aa  257  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
1629 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  33.71 
 
 
828 aa  257  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1795  sensor histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 
654 aa  257  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>