More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4966 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  100 
 
 
951 aa  1900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1141 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  29.8 
 
 
1141 aa  325  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
925 aa  323  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 
1074 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  40.17 
 
 
1084 aa  320  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
1574 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
1070 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  40.79 
 
 
931 aa  307  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  39.56 
 
 
936 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  38.34 
 
 
1088 aa  294  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
936 aa  290  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  40.43 
 
 
935 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  39.21 
 
 
1083 aa  288  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.71 
 
 
955 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.31 
 
 
949 aa  285  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.46 
 
 
951 aa  284  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.38 
 
 
934 aa  283  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.67 
 
 
951 aa  282  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.5 
 
 
949 aa  282  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.5 
 
 
957 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.5 
 
 
949 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.49 
 
 
948 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.49 
 
 
948 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.49 
 
 
915 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.49 
 
 
948 aa  280  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.29 
 
 
948 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.29 
 
 
949 aa  278  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.24 
 
 
949 aa  277  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.24 
 
 
949 aa  277  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.29 
 
 
949 aa  277  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  37.9 
 
 
1122 aa  277  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.24 
 
 
933 aa  276  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  36.29 
 
 
949 aa  276  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  36.24 
 
 
933 aa  276  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.29 
 
 
949 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.09 
 
 
949 aa  275  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.02 
 
 
957 aa  273  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  37.23 
 
 
1309 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  38.1 
 
 
1053 aa  271  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1436 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
1251 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.1 
 
 
1177 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
964 aa  260  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.46 
 
 
2213 aa  259  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
816 aa  258  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.24 
 
 
2035 aa  257  6e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.15 
 
 
1442 aa  257  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
1202 aa  257  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
782 aa  257  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  36.06 
 
 
1353 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  30 
 
 
1070 aa  254  8.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1436 aa  253  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
920 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
1418 aa  253  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
833 aa  252  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1022 aa  252  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1374 aa  251  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4626  two-component regulatory system sensor kinase  33.55 
 
 
983 aa  251  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185559  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1310 aa  251  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 
1768 aa  250  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1165 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  36.42 
 
 
774 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1032 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.02 
 
 
1763 aa  248  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1303 aa  247  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1240 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  36.44 
 
 
855 aa  247  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
1029 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
916 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
1767 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.21 
 
 
784 aa  245  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  32.27 
 
 
783 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1611 aa  244  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1313 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30 
 
 
1653 aa  244  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  34.31 
 
 
1098 aa  244  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
738 aa  243  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.98 
 
 
796 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.14 
 
 
923 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
1767 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
1767 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1498 aa  242  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1786 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
929 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
1255 aa  242  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
1771 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
744 aa  241  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1194 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.54 
 
 
1109 aa  241  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  33.78 
 
 
1175 aa  240  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.37 
 
 
918 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
928 aa  240  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1582 aa  240  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1765 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
682 aa  240  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
919 aa  240  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.21 
 
 
918 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.21 
 
 
918 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.21 
 
 
918 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>