More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3413 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1093 aa  2195    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  97.9 
 
 		 1093 aa  2082    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.11 
 
 		 1069 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  71.74 
 
 		 1091 aa  1539    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  86.41 
 
 		 1090 aa  1841    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  38.21 
 
 		 948 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  38.18 
 
 		 992 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  41.31 
 
 		 1206 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  40.65 
 
 		 751 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1214 aa  406  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.24 
 
 		 1191 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.21 
 
 		 1201 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1642  putative PAS/PAC sensor protein  42.03 
 
 		 796 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0928458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 		 1210 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  42.1 
 
 		 1215 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  41.08 
 
 		 1211 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  46.45 
 
 		 1212 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 1196 aa  360  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  45.12 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  45.24 
 
 		 741 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2316  sensor histidine kinase/response regulator  44.98 
 
 		 477 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2366  histidine kinase  35.71 
 
 		 697 aa  312  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  39.21 
 
 		 1209 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 1049 aa  294  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 		 1213 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  42.93 
 
 		 968 aa  282  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  38.17 
 
 		 1199 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2834  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 808 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  29.54 
 
 		 830 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 		 1070 aa  273  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 812 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.92 
 
 		 651 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1612  histidine kinase  41.41 
 
 		 448 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.786857  normal  0.263527 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  31.1 
 
 		 830 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 764 aa  269  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  38.1 
 
 		 1197 aa  268  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1197 aa  268  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  38.1 
 
 		 1197 aa  268  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1197 aa  268  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  38.1 
 
 		 1197 aa  268  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  37.89 
 
 		 1197 aa  267  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  37.25 
 
 		 882 aa  266  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  37.68 
 
 		 1197 aa  265  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  37.58 
 
 		 1127 aa  264  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  40.76 
 
 		 651 aa  263  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 		 781 aa  261  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  37.47 
 
 		 1127 aa  261  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 643 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  41.13 
 
 		 1286 aa  261  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  42.28 
 
 		 1040 aa  261  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1251 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 818 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 643 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4472  PAS  45.76 
 
 		 679 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 633 aa  255  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 643 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 829 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  25.53 
 
 		 1574 aa  253  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 1433 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 724 aa  252  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.7 
 
 		 853 aa  252  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 		 643 aa  252  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 808 aa  251  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 808 aa  251  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 896 aa  251  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 913 aa  251  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 743 aa  250  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  42.26 
 
 		 742 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 718 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 817 aa  247  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 		 968 aa  245  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  30.88 
 
 		 922 aa  245  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 631 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 815 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 1195 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.47 
 
 		 1560 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 846 aa  243  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.2 
 
 		 645 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  36.07 
 
 		 952 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 1127 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 862 aa  241  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 601 aa  241  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  28.31 
 
 		 782 aa  240  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 1141 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  41.19 
 
 		 853 aa  239  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 554 aa  239  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 822 aa  238  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 948 aa  238  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.83 
 
 		 763 aa  238  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 801 aa  238  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 1199 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 597 aa  238  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.76 
 
 		 620 aa  237  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 674 aa  237  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1177 aa  237  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1059 aa  237  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  42.03 
 
 		 1177 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  41.84 
 
 		 735 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1029 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  35.95 
 
 		 1032 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>