More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0308 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  100 
 
 		 506 aa  1041    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.45 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.8 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  25.06 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  24.3 
 
 		 400 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.47 
 
 		 602 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.25 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.93 
 
 		 389 aa  95.1  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.8 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.63 
 
 		 400 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  23.98 
 
 		 393 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  23.98 
 
 		 393 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.65 
 
 		 392 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.98 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.63 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  25.28 
 
 		 391 aa  87.8  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.35 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  24.37 
 
 		 394 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.85 
 
 		 941 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 371 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  23.71 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  23.66 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.47 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  24.88 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.66 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.12 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.61 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  24.49 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.7 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0183  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111128  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  24.49 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  24.49 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  24.2 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  24.49 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  24.49 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  24.49 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25.64 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  23.66 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.45 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.15 
 
 		 1020 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.29 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  25.43 
 
 		 577 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  24.29 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 125 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.63 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  25.89 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  25.37 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  24.01 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.12 
 
 		 526 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.43 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.13 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  22.98 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.8 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.31 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.46 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.3 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3108  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  23.37 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.67 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  30 
 
 		 1342 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.57 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  21.7 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  36.3 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1274 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.61 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 1316 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 245 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.8 
 
 		 418 aa  76.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.67 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 846 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.77 
 
 		 509 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  23.12 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.83 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  32.53 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.76 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0703  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  21.69 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02660  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.646611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  28.8 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  22.25 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.01 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4521  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>