More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2116 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2116  response regulator receiver protein  100 
 
 		 171 aa  346  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2102  response regulator receiver protein  90.06 
 
 		 171 aa  287  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 153 aa  101  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  38.36 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  35.82 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.3 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 162 aa  97.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  34.76 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.51 
 
 		 146 aa  94.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 153 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  37.41 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.59 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  36.23 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 146 aa  88.2  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 146 aa  87.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  33.8 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  36.43 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  31.06 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  32.87 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  30.3 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  29.29 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  31.47 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  28.99 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.34 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  32.37 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  29.87 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  33.82 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  28.47 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  30.07 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  30.06 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>