More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1909 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1909  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5172  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.61 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.07 
 
 		 470 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 579 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3202  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  35.29 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4784  response regulator receiver protein  35 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  38.82 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1012  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175734  normal  0.0400951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  41.25 
 
 		 741 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4715  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.9 
 
 		 589 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 738 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5333  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 935 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 433 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.7 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 752 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2976  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 		 474 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1702  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1974  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1889  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  37.14 
 
 		 242 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 242 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2881  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000073998  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  37.93 
 
 		 206 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 221 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.48 
 
 		 244 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  33.05 
 
 		 242 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1989  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  35.83 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.39 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  35.83 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  35.34 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  37.65 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 991 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  32.46 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 410 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 		 1180 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  35.34 
 
 		 1347 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  31.15 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2080  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.02 
 
 		 461 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  37.1 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.1 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0824  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0263767  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  33.9 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  37.1 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  37.1 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  33.06 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 650 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 397 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  37.1 
 
 		 461 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  37.1 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.52 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 811 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>