More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4715 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4715  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.15 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.15 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.92 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.92 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  53.72 
 
 		 206 aa  197  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  48.45 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2665  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 133 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 321 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2336  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 133 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103968  normal  0.760096 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4740  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318753  normal  0.272493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1965  response regulatory protein, sigma 54 related  41.53 
 
 		 384 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0275961  normal  0.129103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  33.73 
 
 		 227 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3782  response regulator receiver protein  51.81 
 
 		 110 aa  90.9  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.4 
 
 		 465 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 503 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 317 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.72 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 466 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  38.84 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 247 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  30.05 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.83 
 
 		 348 aa  88.2  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 265 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  34.03 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.8 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  30.81 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  39.67 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.68 
 
 		 456 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 384 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  32.77 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 278 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 224 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 234 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 338 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  36.2 
 
 		 336 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 365 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1510  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 374 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 374 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  36.03 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  33 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 303 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.52 
 
 		 971 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0242  two-component regulator  39.67 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.45 
 
 		 451 aa  85.1  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 218 aa  84.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.8 
 
 		 229 aa  84.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  42.5 
 
 		 403 aa  84.7  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  31.87 
 
 		 221 aa  84.7  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  31.12 
 
 		 1342 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.19 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1085  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  44.55 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0382601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  38.98 
 
 		 705 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  32.5 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  38.02 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  33.15 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.41 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40 
 
 		 1020 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.52 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1119  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1771  PAS:GGDEF  37.5 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  32.93 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.97 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>