More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1702 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1702  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5729  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.86 
 
 		 488 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1106  response regulator receiver protein  40 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33.61 
 
 		 1384 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5333  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  37.7 
 
 		 1373 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.88 
 
 		 1378 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  39.25 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  47.62 
 
 		 377 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  39.32 
 
 		 1343 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  33.9 
 
 		 1376 aa  77  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5913  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  32.76 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  35.83 
 
 		 1404 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  36.89 
 
 		 1373 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 340 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  38.98 
 
 		 1643 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 566 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2211  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 306 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 441 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  40.59 
 
 		 312 aa  73.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  40 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 935 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  38.24 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.64 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  33.86 
 
 		 1374 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  31.9 
 
 		 229 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  36.9 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 		 437 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  32.12 
 
 		 1342 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  34.13 
 
 		 734 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.91 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 297 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1049 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 229 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 227 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.78 
 
 		 379 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 326 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 989 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  34.45 
 
 		 1355 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  29.14 
 
 		 352 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 460 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0996419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  33.63 
 
 		 619 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 904 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.58 
 
 		 308 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  38.46 
 
 		 326 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  0.282737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 254 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 245 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 1274 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 407 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.58 
 
 		 331 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 226 aa  70.1  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.82 
 
 		 233 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 200 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 353 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  30.61 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  34.71 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>