More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4784 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4784  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  50.49 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  50.49 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3202  response regulator receiver protein  48.54 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 576 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  37.96 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5172  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 633 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.11 
 
 		 227 aa  77  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5170  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  40.8 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1398  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  39.77 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 		 440 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.83 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.21 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5729  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 326 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0868  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.86 
 
 		 650 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.65 
 
 		 239 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1631 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.35 
 
 		 231 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2064  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1390 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1509  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 452 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0726  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  41.57 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1390 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1390 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  33.63 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1909  response regulator receiver protein  35 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 1349 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  37.35 
 
 		 231 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 1370 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2657  response regulator receiver  30.56 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  0.494085 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7238  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24892  normal  0.77163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  46.25 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 1131 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1702  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1889  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.75 
 
 		 1177 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  35.83 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  43.04 
 
 		 436 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1974  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 1010 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4333  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 706 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  40.66 
 
 		 1366 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  37.08 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  44.58 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 452 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 2137 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  32.03 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1989  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1426 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 566 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 2022 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6598  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.165096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  35.25 
 
 		 1983 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.16 
 
 		 869 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  39.51 
 
 		 705 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  37.08 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0001  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  37.08 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 579 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  39.76 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5913  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 2414 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  38.2 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  31.82 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>