More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5170 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5170  response regulator receiver protein  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916187 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7238  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24892  normal  0.77163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2881  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 123 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000073998  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4784  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1002 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4285  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.13 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 1631 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 633 aa  75.1  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 		 1180 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  36.75 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 119 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 961 aa  73.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.72 
 
 		 1560 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 		 1156 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6598  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.165096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 		 1172 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.57 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.75 
 
 		 905 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2580  response regulator receiver domain-containing protein  40.37 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2756  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3466  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.12169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  40 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 124 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 137 aa  72  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  36.75 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 		 1049 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 374 aa  71.6  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  34.75 
 
 		 734 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 708 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 120 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 769 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 125 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 124 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  32.24 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  32.14 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  32.2 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  33.04 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  45 
 
 		 769 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 118 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  33.04 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.58 
 
 		 858 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.91 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  31.76 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  30.63 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  28.81 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 823 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  33.56 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 865 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 762 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 486 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5913  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>