More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1398 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1398  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  241  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.77 
 
 		 1366 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  37.29 
 
 		 705 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.37 
 
 		 1131 aa  80.5  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1370 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  33.87 
 
 		 1373 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  32.52 
 
 		 1355 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4784  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  33.33 
 
 		 1278 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1385 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1287 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 1341 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  35.71 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  33.9 
 
 		 705 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  35.45 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 927 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1426 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 991 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  33.33 
 
 		 326 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  36.13 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0174  response regulator receiver  37.61 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  33.87 
 
 		 1324 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1390 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 259 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1390 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1390 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 265 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.67 
 
 		 1378 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  34.75 
 
 		 265 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0804  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 314 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4451  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30 
 
 		 314 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1415 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 823 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.48 
 
 		 466 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  32.71 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 500 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 977 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  33.9 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  32.2 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1361 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 476 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 262 aa  67.8  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  33.9 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  33.9 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  32.38 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  31.78 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  32.38 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  29.51 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  33.62 
 
 		 1316 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  32.73 
 
 		 469 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1631 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 477 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  31.78 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 233 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.42 
 
 		 481 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 370 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  32.48 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.42 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 1003 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1651 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 974 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  34.86 
 
 		 1299 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  33.05 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.86 
 
 		 1514 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  36.21 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.86 
 
 		 1514 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>