More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3108 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  52.5 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  50.83 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  52.5 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  50 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  49.17 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  127  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  48.33 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  50 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  49.15 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 123 aa  123  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  45.08 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  45 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  44.92 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4293  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1274 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1390 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1390 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1390 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 		 1352 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.83 
 
 		 763 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 1370 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1385 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 1361 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1287 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  36.52 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1977 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  37.61 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1172 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1044 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 397 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  37.27 
 
 		 1322 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 764 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 1959 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 939 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1245 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  32.79 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 917 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1038  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 380 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 		 827 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1651 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2207  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1407 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1629 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 237 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.93 
 
 		 2213 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5056  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 305 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 228 aa  77  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1021 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.13 
 
 		 1156 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 902 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 823 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  39.32 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1271 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>