More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5729 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5729  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1702  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  45.37 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  45.12 
 
 		 229 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  42.68 
 
 		 230 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 230 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  43.9 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  45.12 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  43.75 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.37 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.37 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  44.19 
 
 		 326 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.99 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  34.92 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 226 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 235 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 309 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1106  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  48.78 
 
 		 1374 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 383 aa  76.6  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0918  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.99 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.25 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5913  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  41.05 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  45.68 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 361 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  40.24 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 228 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  37.5 
 
 		 1373 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 226 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.37 
 
 		 226 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.86 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.58 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  43.21 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6643  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000647655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4784  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  41.25 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2211  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  37.1 
 
 		 1373 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 576 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.37 
 
 		 331 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 353 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  43.21 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 410 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  43.75 
 
 		 458 aa  70.9  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 292 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.09 
 
 		 222 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.17 
 
 		 488 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  33.59 
 
 		 1335 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  44.58 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 309 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  35.92 
 
 		 705 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 		 331 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>