More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6643 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6643  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000647655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3698  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 125 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819112  hitchhiker  0.0000139648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6598  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.165096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2580  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5729  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1974  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1702  response regulator receiver protein  35 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1889  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1989  response regulator receiver domain-containing protein  39.09 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5913  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 163 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2064  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  33.88 
 
 		 1327 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.03 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  33.94 
 
 		 337 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  29.37 
 
 		 1363 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1515  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  34.62 
 
 		 391 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  35.29 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 719 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 473 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  33.9 
 
 		 468 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7238  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24892  normal  0.77163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2443  response regulator receiver domain-containing protein  40.2 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3202  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 232 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  31.09 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 		 385 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  33.05 
 
 		 472 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  29.75 
 
 		 1334 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5170  response regulator receiver protein  36 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02660  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.8 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.646611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  31.75 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  32.54 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2666  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.800154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2366  DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2893  response regulator  26.09 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000624978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2621  two-component response regulator  26.09 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2877  DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  32.54 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  32.54 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 		 593 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2867  DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 215 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000859212 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1147  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 188 aa  60.1  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  31.54 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  33.33 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  31.9 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2910  DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  39.13 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0732  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 471 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  27.5 
 
 		 1355 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  25.64 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2525  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 978 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  33.64 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 902 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  30.95 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  31.82 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01723  two-component system response regulator  32.23 
 
 		 446 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2645  response regulator  37.29 
 
 		 447 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0366662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 962 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  29.66 
 
 		 506 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30830  putative two-component response regulator  36.84 
 
 		 447 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0592396  hitchhiker  0.000000000000489784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  38.26 
 
 		 475 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  30.95 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5333  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  38.26 
 
 		 475 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>