More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3698 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3698  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819112  hitchhiker  0.0000139648 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6643  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000647655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5913  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2580  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6598  response regulator receiver protein  45 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.165096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  35.38 
 
 		 391 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1702  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 473 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5729  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  35 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5333  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  31.78 
 
 		 456 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 463 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 962 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 456 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  38.79 
 
 		 264 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 470 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.35 
 
 		 584 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 293 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2062  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.03 
 
 		 449 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000496565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  37.37 
 
 		 593 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2160  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.03 
 
 		 449 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 1049 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  36.75 
 
 		 457 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.97 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5170  response regulator receiver protein  35 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3202  response regulator receiver protein  35 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 938 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 235 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2366  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  35.24 
 
 		 945 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 		 472 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 373 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 		 472 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  36.97 
 
 		 365 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.93 
 
 		 1380 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2443  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2666  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.800154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  29.82 
 
 		 822 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1069  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0511705  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2893  response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000624978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  33.9 
 
 		 455 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2621  two-component response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 469 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  30.17 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.15 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  35.9 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1996  GGDEF domain-containing protein  32.1 
 
 		 855 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.473093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.15 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  35.9 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  30.09 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1588 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 469 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  34.45 
 
 		 439 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  34.45 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2877  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  34.45 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2867  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000859212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  34.45 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  34.45 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.9 
 
 		 394 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>