More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1157 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  100 
 
 		 822 aa  1676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  42.24 
 
 		 846 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  40.62 
 
 		 849 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 826 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 704 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 716 aa  251  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 701 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 852 aa  221  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 699 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 857 aa  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 841 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 852 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 697 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 851 aa  193  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 847 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 857 aa  167  9e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  33.33 
 
 		 681 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  32.54 
 
 		 686 aa  141  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 681 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 409 aa  131  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.85 
 
 		 1078 aa  128  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 		 1199 aa  125  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  30 
 
 		 782 aa  124  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  28.57 
 
 		 856 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 597 aa  121  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1070 aa  119  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  34.34 
 
 		 667 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  28.19 
 
 		 1296 aa  118  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  34.34 
 
 		 667 aa  118  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 		 1193 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 		 1193 aa  118  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1120 aa  118  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 870 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  25.46 
 
 		 742 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 1053 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  29.84 
 
 		 576 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  26.24 
 
 		 620 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  27.46 
 
 		 566 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.2 
 
 		 1116 aa  114  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  29.2 
 
 		 982 aa  113  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.21 
 
 		 804 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 774 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 827 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 1000 aa  111  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  29.63 
 
 		 496 aa  111  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 924 aa  111  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 		 973 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.95 
 
 		 741 aa  110  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1075 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  31.44 
 
 		 420 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 932 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0381  response regulator, histidine kinase  30.4 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 685 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1691 aa  110  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0473  ATP-binding region ATPase domain protein  25.85 
 
 		 719 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 788 aa  109  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1410 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  27.55 
 
 		 786 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  26.08 
 
 		 882 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 1350 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  31 
 
 		 420 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  26.79 
 
 		 802 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 480 aa  107  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  25.06 
 
 		 736 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 865 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 1131 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 		 969 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 		 969 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 957 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  29.22 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 756 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 1070 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1271 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 		 789 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 969 aa  105  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 		 1182 aa  104  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  30.92 
 
 		 847 aa  104  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  30.68 
 
 		 539 aa  104  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 903 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  27.11 
 
 		 1379 aa  104  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1003 aa  104  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 1050 aa  104  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  28.9 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00572  putative signal transduction histidine kinase two-component system with Protein-glutamate methylesterase domain  26.6 
 
 		 919 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  29.7 
 
 		 631 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 		 772 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 		 717 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.48 
 
 		 827 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 1096 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  25.45 
 
 		 497 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 961 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  30.47 
 
 		 697 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  26.79 
 
 		 751 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  28 
 
 		 583 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 934 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  24.04 
 
 		 772 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 903 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 855 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 		 815 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>