More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0862 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  32.13 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.38 
 
 		 994 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3109  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  44.03 
 
 		 965 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  39.58 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  42.42 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.29 
 
 		 515 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 484 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3004  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.85 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.14 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 641 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.14 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 622 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 622 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 		 472 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  38 
 
 		 622 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 		 472 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.95 
 
 		 640 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  30.77 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 495 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 479 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 628 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  29.44 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  39.69 
 
 		 492 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3932  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3981  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000307852  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 		 538 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.16 
 
 		 473 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.49 
 
 		 1355 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 496 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  38.41 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2184  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 497 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.682977  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 520 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 188 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  41.18 
 
 		 481 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  26.11 
 
 		 428 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 395 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  41.18 
 
 		 481 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  41.18 
 
 		 481 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  41.18 
 
 		 481 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  41.18 
 
 		 481 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  37.32 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  34.9 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  42.74 
 
 		 549 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  37.09 
 
 		 456 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  42.74 
 
 		 549 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  40.77 
 
 		 590 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1956  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 486 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.696783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  40.34 
 
 		 481 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  39.72 
 
 		 476 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  36.14 
 
 		 484 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  35.66 
 
 		 151 aa  95.9  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  41.03 
 
 		 439 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  37.27 
 
 		 557 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1465 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.83 
 
 		 860 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3081  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 		 638 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  37.14 
 
 		 1111 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  35.43 
 
 		 563 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  36 
 
 		 553 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.5 
 
 		 317 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0692  response regulator receiver domain-containing protein  41.41 
 
 		 390 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1542  response regulator receiver domain-containing protein  36.88 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150385  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 154 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0430  response regulator receiver protein  35.12 
 
 		 423 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  31.79 
 
 		 189 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  35.37 
 
 		 441 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 449 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  35.92 
 
 		 557 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2808  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 482 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  35.17 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  41.73 
 
 		 403 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 		 1172 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 		 1180 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  33.56 
 
 		 823 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  40.2 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  34.51 
 
 		 438 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  34.07 
 
 		 154 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3060  response regulator receiver  37.78 
 
 		 410 aa  89  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 187 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 154 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 		 1156 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 523 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.67 
 
 		 860 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  27.04 
 
 		 359 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 523 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0406  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  41.18 
 
 		 557 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  37.4 
 
 		 560 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  40.2 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  33.83 
 
 		 439 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  35.81 
 
 		 475 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  35.81 
 
 		 475 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>