More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3004 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3004  response regulator receiver protein  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3981  response regulator receiver protein  56.76 
 
 		 298 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000307852  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3932  response regulator receiver protein  56.76 
 
 		 298 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 283 aa  201  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3293  NarL family two-component response regulator  35.11 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 634 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 759 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0620  putative PAS/PAC sensor protein  37.74 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.51 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.5 
 
 		 637 aa  75.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 874 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 769 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.72 
 
 		 728 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 682 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.61 
 
 		 564 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.83 
 
 		 479 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4358  hypothetical protein  26.64 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1653  guanylate cyclase  36.09 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 644 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  31.94 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.94 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  31.94 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  31.94 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 827 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2672  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.88 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 692 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.73 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  35.19 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  32.06 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  35.19 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.64 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.05 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  29.32 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  34.26 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  26.12 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  28.36 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  27.75 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.92 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 394 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3545  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.77 
 
 		 569 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2907  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3213  two-component hybrid sensor and regulator  29.79 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2820  transcriptional regulatory protein ZraR  28.77 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  27.87 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.06 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.93 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  29.69 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  27.66 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.83 
 
 		 440 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  25.28 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  25.54 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 737 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.24 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  24.26 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.39 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 659 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  27.07 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.54 
 
 		 900 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2452  multisensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 556 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0808  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  31.13 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000531821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3033  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.48 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.190199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2043  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 433 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  28.09 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  27.03 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.19 
 
 		 739 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.25 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 846 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  31.97 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  31.13 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 640 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 		 1133 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  31.13 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  25.62 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>