More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1126 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 
451 aa  874    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  53.9 
 
 
394 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.21 
 
 
389 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  52.45 
 
 
392 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  55.29 
 
 
390 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.56 
 
 
422 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  50.4 
 
 
409 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  50.26 
 
 
421 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  48.83 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  48.83 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  48.83 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  47.97 
 
 
395 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.04 
 
 
418 aa  296  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1576  response regulator receiver modulated serine phosphatase  48.98 
 
 
406 aa  289  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0296276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  43.1 
 
 
423 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  47.38 
 
 
391 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1263  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45.94 
 
 
425 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.799731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  47.38 
 
 
391 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  41.5 
 
 
746 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.85 
 
 
847 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
759 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
634 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.68 
 
 
728 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.7 
 
 
385 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
874 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
553 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.95 
 
 
738 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.12 
 
 
357 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
769 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
553 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
653 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  25 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.85 
 
 
371 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  45.59 
 
 
291 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  33.58 
 
 
694 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
682 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.28 
 
 
637 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.36 
 
 
549 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
644 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
800 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.43 
 
 
817 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.79 
 
 
602 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  33.86 
 
 
260 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.65 
 
 
728 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.59 
 
 
560 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
500 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  31.54 
 
 
721 aa  87  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  26.74 
 
 
394 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 
693 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.19 
 
 
523 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  44.19 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  32.62 
 
 
607 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
693 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.94 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.22 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  30.74 
 
 
743 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.73 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  26.74 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.22 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  43.2 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  43.2 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  43.2 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  43.2 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.01 
 
 
697 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.57 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 
797 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.36 
 
 
700 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.35 
 
 
702 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.74 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.74 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.36 
 
 
564 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  34.65 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  34.65 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.12 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.57 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  26.51 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
1711 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  31.1 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.31 
 
 
549 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1653  guanylate cyclase  32.71 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.67 
 
 
579 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 
697 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  31.2 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
1045 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  34.25 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  50.6 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.96 
 
 
941 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.19 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>