More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0287 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  64.26 
 
 		 728 aa  909    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  100 
 
 		 743 aa  1486    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.3 
 
 		 688 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  50 
 
 		 512 aa  346  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  41.9 
 
 		 425 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.01 
 
 		 694 aa  249  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.94 
 
 		 655 aa  247  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  36.14 
 
 		 800 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 		 693 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  33.33 
 
 		 766 aa  198  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  33.97 
 
 		 581 aa  195  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  40.51 
 
 		 377 aa  171  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  41.06 
 
 		 488 aa  170  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 		 760 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  34.58 
 
 		 956 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  36.1 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  37.77 
 
 		 658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  33.67 
 
 		 633 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  32.34 
 
 		 866 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.03 
 
 		 547 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.38 
 
 		 445 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  33.33 
 
 		 713 aa  138  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.5 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  39.11 
 
 		 456 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  30.7 
 
 		 618 aa  134  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  31.22 
 
 		 865 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.54 
 
 		 453 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  33.22 
 
 		 431 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  33.22 
 
 		 431 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  33.22 
 
 		 431 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  35.9 
 
 		 487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.44 
 
 		 437 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.36 
 
 		 750 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  30.92 
 
 		 723 aa  124  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1711 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  32.85 
 
 		 550 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  32.85 
 
 		 550 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  32.85 
 
 		 550 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  31.76 
 
 		 607 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 		 745 aa  122  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  35.31 
 
 		 685 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.05 
 
 		 817 aa  120  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  28.95 
 
 		 583 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.8 
 
 		 616 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.95 
 
 		 438 aa  119  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.34 
 
 		 730 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.25 
 
 		 563 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  25.04 
 
 		 584 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  28.82 
 
 		 721 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  30.14 
 
 		 525 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.44 
 
 		 612 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.23 
 
 		 1332 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 		 574 aa  114  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  31.07 
 
 		 765 aa  114  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  29.74 
 
 		 932 aa  114  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  32.92 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.9 
 
 		 1017 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  30.24 
 
 		 550 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.07 
 
 		 957 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  33.8 
 
 		 557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  31.08 
 
 		 706 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  29.66 
 
 		 631 aa  111  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.76 
 
 		 1004 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.23 
 
 		 573 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.49 
 
 		 553 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.57 
 
 		 465 aa  110  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 393 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 393 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 393 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  28.57 
 
 		 585 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.27 
 
 		 549 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.9 
 
 		 961 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 		 693 aa  107  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  25.08 
 
 		 781 aa  106  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  29.61 
 
 		 465 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  29.45 
 
 		 572 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  27.79 
 
 		 591 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.83 
 
 		 688 aa  106  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  30.42 
 
 		 716 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 		 570 aa  106  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  34.22 
 
 		 709 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  33.03 
 
 		 753 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  36.48 
 
 		 649 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 		 614 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 		 776 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.45 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.34 
 
 		 532 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.18 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.03 
 
 		 572 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  31.62 
 
 		 687 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  31.56 
 
 		 697 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.9 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.67 
 
 		 1051 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  30.36 
 
 		 708 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>