More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4164 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
688 aa  1392    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 
855 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.09 
 
 
817 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.94 
 
 
1039 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.4 
 
 
573 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.07 
 
 
1045 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.31 
 
 
697 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.26 
 
 
579 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  41.5 
 
 
591 aa  210  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.88 
 
 
616 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  31.45 
 
 
594 aa  207  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 
713 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  29.13 
 
 
866 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 
547 aa  180  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
932 aa  174  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.42 
 
 
560 aa  174  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  29.71 
 
 
865 aa  173  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 
765 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.94 
 
 
553 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 
776 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  29.94 
 
 
685 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  35.69 
 
 
1432 aa  167  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  31.71 
 
 
753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  35.02 
 
 
562 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  32.37 
 
 
607 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  30.72 
 
 
700 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 
760 aa  164  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  28.09 
 
 
574 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  28.45 
 
 
607 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.3 
 
 
583 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  28.6 
 
 
730 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  28.52 
 
 
722 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  30.67 
 
 
676 aa  158  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
1711 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  30.8 
 
 
580 aa  153  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.22 
 
 
952 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.69 
 
 
697 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  37.15 
 
 
693 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 
692 aa  151  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  36.57 
 
 
713 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  41.13 
 
 
672 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  34.08 
 
 
721 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 
757 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  35.12 
 
 
537 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  35.5 
 
 
723 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.6 
 
 
750 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 
956 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30.8 
 
 
744 aa  144  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  37.55 
 
 
688 aa  144  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  28.55 
 
 
570 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.73 
 
 
702 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  36.01 
 
 
618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  28.82 
 
 
754 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.51 
 
 
525 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  36.63 
 
 
583 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
581 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.7 
 
 
738 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  35.92 
 
 
709 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.04 
 
 
692 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.73 
 
 
529 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.82 
 
 
828 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.19 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  40.55 
 
 
797 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 
627 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.4 
 
 
830 aa  134  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  28.06 
 
 
930 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.33 
 
 
847 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
1361 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 
1225 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
1248 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  45.96 
 
 
585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
1385 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.88 
 
 
585 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  34.81 
 
 
431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  34.81 
 
 
431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30 
 
 
743 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  34.81 
 
 
431 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  28.42 
 
 
544 aa  129  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  34.12 
 
 
652 aa  127  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.56 
 
 
1051 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.46 
 
 
576 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  35.51 
 
 
745 aa  126  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 
614 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  38.2 
 
 
738 aa  123  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.73 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.13 
 
 
450 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  33.78 
 
 
512 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
1370 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  26.74 
 
 
670 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  31.05 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.29 
 
 
851 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.22 
 
 
549 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  27.48 
 
 
572 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.09 
 
 
711 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  38.81 
 
 
528 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 
1017 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  35.1 
 
 
694 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>