More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0433 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
627 aa  1219    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  49.33 
 
 
614 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  44.23 
 
 
607 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  42.22 
 
 
546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  45.84 
 
 
652 aa  297  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  56.47 
 
 
427 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  46.41 
 
 
866 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  37.24 
 
 
865 aa  270  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  46.79 
 
 
932 aa  249  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  49.81 
 
 
576 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 
544 aa  243  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  46.38 
 
 
562 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  47 
 
 
930 aa  223  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  43.69 
 
 
730 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.15 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  35.74 
 
 
547 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  44.98 
 
 
572 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  36.18 
 
 
618 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.97 
 
 
450 aa  203  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  44.34 
 
 
308 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.13 
 
 
613 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.9 
 
 
775 aa  194  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  40.24 
 
 
585 aa  191  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  44.82 
 
 
576 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
770 aa  190  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  40.92 
 
 
723 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  45.53 
 
 
567 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  46.47 
 
 
692 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 
574 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  31.32 
 
 
607 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
1711 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  39.31 
 
 
583 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.59 
 
 
700 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1248 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  36.33 
 
 
692 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 
693 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 
760 aa  150  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.27 
 
 
688 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  35.42 
 
 
670 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.45 
 
 
697 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 
688 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  44.34 
 
 
847 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  37.03 
 
 
570 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  41.45 
 
 
797 aa  143  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.24 
 
 
560 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  39.48 
 
 
757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  37.07 
 
 
828 aa  142  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.97 
 
 
952 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1390 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1390 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
1385 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1390 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.73 
 
 
453 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  37.25 
 
 
816 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.24 
 
 
1039 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.15 
 
 
702 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 
580 aa  134  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  41.35 
 
 
260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  35.4 
 
 
537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  35.78 
 
 
816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  41.77 
 
 
1017 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  33.83 
 
 
753 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  35.57 
 
 
851 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.17 
 
 
1301 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.25 
 
 
573 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 
1432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 
581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  45.51 
 
 
409 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
716 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  35.87 
 
 
591 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.59 
 
 
532 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
1361 aa  127  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
579 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 
744 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.88 
 
 
738 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  35.71 
 
 
771 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 
745 aa  124  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 
676 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.91 
 
 
817 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  32.12 
 
 
746 aa  120  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.14 
 
 
750 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.35 
 
 
697 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  36.43 
 
 
713 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.98 
 
 
728 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 
643 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  29.41 
 
 
743 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  37.71 
 
 
772 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  35.18 
 
 
594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.86 
 
 
743 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.18 
 
 
538 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  28.72 
 
 
709 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
1370 aa  114  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.5 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  38.02 
 
 
755 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  30.41 
 
 
754 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  26.57 
 
 
713 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.55 
 
 
616 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 
776 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>