More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3812 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
757 aa  1457    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  41.48 
 
 
721 aa  293  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  38.41 
 
 
562 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.32 
 
 
573 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  37.16 
 
 
547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  36.71 
 
 
760 aa  183  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.11 
 
 
616 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  36.94 
 
 
607 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.38 
 
 
1039 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.34 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36 
 
 
750 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.16 
 
 
553 aa  174  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  42.9 
 
 
614 aa  174  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  35.73 
 
 
713 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 
685 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.35 
 
 
1045 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  35.45 
 
 
618 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  33.41 
 
 
585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  33.18 
 
 
591 aa  164  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  32.53 
 
 
744 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  43.19 
 
 
427 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  31.2 
 
 
753 aa  160  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
581 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4077  putative PAS/PAC sensor protein  63.39 
 
 
135 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.68 
 
 
379 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
1711 aa  157  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.77 
 
 
688 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.51 
 
 
817 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  39.25 
 
 
693 aa  154  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
866 aa  154  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  33.49 
 
 
574 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  36.12 
 
 
572 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
1385 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  37.39 
 
 
700 aa  152  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.55 
 
 
697 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
1390 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
1390 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 
865 aa  151  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
1390 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 
709 aa  151  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  40.8 
 
 
652 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  34.22 
 
 
607 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  32.17 
 
 
765 aa  150  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  43.42 
 
 
828 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  35.96 
 
 
956 aa  147  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.39 
 
 
952 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.06 
 
 
585 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  33.49 
 
 
855 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.24 
 
 
697 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  36.77 
 
 
692 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.44 
 
 
576 aa  145  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  36.3 
 
 
537 aa  144  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.66 
 
 
692 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  33.48 
 
 
723 aa  143  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.2 
 
 
728 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 
776 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 
583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
1361 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  39.16 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
544 aa  141  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  39.5 
 
 
546 aa  141  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.56 
 
 
754 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  44.58 
 
 
770 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 
676 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 
713 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 
932 aa  137  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  40.36 
 
 
851 aa  137  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.01 
 
 
450 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.6 
 
 
738 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.98 
 
 
688 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3852  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
391 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.83404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.01 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  37.58 
 
 
1432 aa  134  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.2 
 
 
743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.18 
 
 
1051 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
1248 aa  132  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.49 
 
 
453 aa  131  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.11 
 
 
583 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33 
 
 
702 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.88 
 
 
730 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
722 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
643 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
1370 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  42.8 
 
 
1017 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.57 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  30.9 
 
 
694 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.6 
 
 
529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  28.38 
 
 
670 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  47.29 
 
 
395 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  35.4 
 
 
716 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.46 
 
 
672 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.36 
 
 
1332 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  49.22 
 
 
456 aa  127  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
427 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.9 
 
 
693 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  43.84 
 
 
391 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  47.55 
 
 
391 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.43 
 
 
525 aa  124  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>