More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2632 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
427 aa  847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  54.73 
 
 
456 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  49.75 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  49.75 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  49.5 
 
 
393 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  47.72 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3852  putative PAS/PAC sensor protein  49.11 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.83404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  43.31 
 
 
391 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.86 
 
 
438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.51 
 
 
445 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
512 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 
488 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  37.6 
 
 
633 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  41.63 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  41.63 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  41.63 
 
 
431 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  35.09 
 
 
425 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  37.4 
 
 
694 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  48.92 
 
 
757 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
379 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  35.04 
 
 
743 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.7 
 
 
728 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  36.54 
 
 
693 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  35.87 
 
 
581 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.47 
 
 
437 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4077  putative PAS/PAC sensor protein  53.57 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.43 
 
 
688 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.58 
 
 
792 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.33 
 
 
619 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 
693 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  37.76 
 
 
487 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.11 
 
 
549 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
776 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
776 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.1 
 
 
1051 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  42.67 
 
 
395 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  33.96 
 
 
800 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  30.98 
 
 
612 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.01 
 
 
572 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.56 
 
 
474 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
442 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  40.27 
 
 
391 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.61 
 
 
557 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  34.82 
 
 
525 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.8 
 
 
655 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  28.51 
 
 
459 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  32.57 
 
 
566 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.19 
 
 
706 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  35.77 
 
 
550 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  36.55 
 
 
574 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
375 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 
460 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 
846 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  35.55 
 
 
648 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  30.96 
 
 
463 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
649 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  33.07 
 
 
683 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  30.92 
 
 
469 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  31.82 
 
 
470 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.77 
 
 
708 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.02 
 
 
465 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 
705 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.82 
 
 
1017 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  33.83 
 
 
649 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.18 
 
 
526 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  29.39 
 
 
687 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  31.79 
 
 
644 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.4 
 
 
467 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.47 
 
 
692 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  31.62 
 
 
465 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  34.44 
 
 
550 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  34.44 
 
 
550 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  34.44 
 
 
550 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.4 
 
 
1004 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 
738 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.82 
 
 
584 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
393 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  30.45 
 
 
637 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  29.06 
 
 
477 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.28 
 
 
482 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  34.11 
 
 
585 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.26 
 
 
688 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  36.23 
 
 
760 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0376  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000066026  normal  0.449331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  33.04 
 
 
462 aa  98.2  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  32.31 
 
 
657 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  26.79 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  29.55 
 
 
766 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  26.79 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  29.1 
 
 
716 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4364  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.33 
 
 
572 aa  97.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 
452 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.04 
 
 
678 aa  96.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  32.92 
 
 
781 aa  95.9  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  33.2 
 
 
341 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.87 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  30.94 
 
 
618 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>